面对疫情初期的严峻形势，他与专家们科学提议多学科医疗组下沉、增设重症收治医院、全国重症驰援、创建方舱医院……为稳定抗疫形势、扭转被动局面作出突出贡献。
《新闻联播》播出邱海波教授介绍救治情况。除了向中央指导组提出建议外，邱海波教授充分利用媒体记者采访、新闻发布会等途径，凭借自己扎实的专业素养、临床诊治经验等，直面各种疑问，回应热点问题，做好社会心理稳定疏导工作。
邱海波教授介绍向国际同道分享救治经验的情况。除此之外，随着全球战疫打响，始终战斗在武汉前线的邱海波教授多次应邀与意大利、西班牙、英国、美国、黎巴嫩、希腊、巴基斯坦、伊朗、加拿大等国家和地区开展视频交流，向国外同行分享中国抗疫经验，在全球战疫中，彰显中国力量与医者情怀。
根据国家统一部署，4月15日前所有援鄂医疗队撤离，仅留下一支20人的专家团队，邱海波教授作为国家专家组留下的专家之一，驻点在武汉协和医院西院区继续指导武汉重症救治。
4月24日，武汉重症新冠肺炎患者清零！4月26日，邱海波教授等国家卫健委专家组离开了他战斗了99天的武汉，一起前往天河机场，转战东北。
4月26日下午，邱海波教授接到新的指令，当天下午飞往吉林长春，再转道奔赴黑龙江继续战斗！5月13日下午，在黑龙江哈尔滨指导抗疫的邱海波教授，陪同孙春兰副总理一行，从黑龙江哈尔滨转战吉林省吉林市指导抗疫。
邱海波教授在吉林指导重症患者救治。如何把湖北的抗疫经验带到东北的呢？5月19日，央视《新闻1+1》节目连线来邱海波教授，他就“今日疫情分析：救治，从武汉到东北”进行来解答。
邱海波教授把武汉到抗疫经验带到了东北，圆满完成任务。为感谢邱海波教授和杨毅教授等国家级专家在新冠肺炎疫情期间，对吉林市的医疗救治指导与帮助，吉林市委、市政府为他们颁发了“感谢状”。
6月5日下午，鏖战139天的邱海波教授，圆满完成国家赋予的使命，带着满满战果，返回南京，平安凯旋！
邱海波教授，回来了！记者们闻讯赶来，采访场面人从众，经过了139天的鏖战，邱海波教授最想说的是什么？
从冬天到夏天，终于看见您回来了，有什么特别想说的吗？
邱教授：从1月出发，到今天回来，其实是个挺难忘的经历。经历了武汉保卫战、黑龙江保卫战以及吉林保卫战，这几场战疫打得都很漂亮。尽管开始很艰苦，但收官还是很完美的。
在这个过程中，真的体现了国家的力量，社会的力量，体现了老百姓的支持，也体现了我们的医疗卫生队伍是能打硬战、恶战的。这个过程不容易，但看到了今天的胜利。
从疫情开始到现在，抗疫方面的总结有哪些？
邱教授：在武汉抗疫期间，形成了7版《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》，对病人诊疗的判断是越来越成熟，所以在黑龙江、吉林，更多的我们要分析输入关联性的病例和湖北武汉的病例有什么不同，在这样一个新的特点下，治疗是否能做得更规范。
在治疗上更规范了，治疗上更积极了，治疗上关口也提得更早。所以我们能看到，黑龙江、吉林救治成功率远远高于早期，这也是我们最希望得到的结果。
当问道回来最想干什么？
邱教授回答：“在外面时间有点长了，其实应该上班了。”
换个战场继续跟死神抢人！
至此，中大医院22名抗疫勇士全部圆满完成任务，平安凯旋！