司令办公室内。
两个人正在对话。
“初号机的受损程度很严重啊。”
老人说。
戴着眼镜十指交叉的碇源堂赞同地点了点头：“嗯，看来修复要很多天了，希望这段时间使徒不会再来。”
“没想到葛城竟然做出这么大胆的计划，at力场我们到现在还没研究透呢。”
“有初号机在，不管怎么样都不会失败的。”
碇源堂信心十足地说。
eva机体。
是由复制第一使徒亚当而来。
但只有初号机是个例外，因为初号机是地下都市里那只使徒的复制品。
是的。
地下都市里的那只使徒。
并非是第一使徒亚当，而是人类发现的第二使徒莉莉丝。碇源堂以第一使徒亚当的名义，向外伪装了真相，并且把第二使徒莉莉丝称呼为第一使徒亚当。而那些来入侵的使徒，似乎也分不清其中的差别。
当然最主要的，还是初号机里面的灵魂。
她会主动保护一切的。
两人离开本部一个星期多。
回来后要忙碌的事情积攒了许多。
文件一份份地盖章签字，却不见明显的减少，冬月耕造随手拿起一份报告书，老人看了没几个字，就原地不动地陷入了惊讶之中，立刻吸引了那边碇源堂的注意力。
“怎么了？”
“不…”
碇源堂从老人手中接过来报告书，看了几眼就皱起眉头。
他的脸色有些抽筋。
因为这是份对驾驶员们的监视报告。
这么多年，他很少有这么失态的时候。在离开的这个星期里，eva机体的两个驾驶员——碇真嗣和绫波丽的关系突飞猛进，快到任何人都没反应过来。本部的情报部实在是太失职了，简直是群虫豸，他们平时到底是怎么监视驾驶员们的？
甚至是事后翻垃圾袋发现了安全措施，才确定这两人发生了关系。
“碇。”
冬月耕造，这个老人站在一旁。
虽然心里有些五味杂陈，但老人对这份报告书的内容倒是不置可否，倒不如说，他乐于见到这个结果，他和碇源堂这个家伙从来就不是一路人。
绫波丽。
她是自己那位学生的克隆人。
这本是冬月耕造绝望之下的产物，在十几年前那场实验事故中，只有极少数人知道那场实验的真相——那位学生和初号机融为了一体，不，称之为死去或许更为合适吧，因为她再也回不来了。
于是冬月耕造提取了当时初号机体内，那位学生所残留下的dna。在利用第二使徒的体细胞制造克隆人时，加入了她的dna。
却没想到促成了一个奇迹。
——绫波丽。
人类的身体，使徒的灵魂。
克隆人的她拥有着地下都市那只使徒的灵魂，简直不可思议，这本来是个肯定会失败的实验，却没想到竟然成功了——这就是那个冬月耕造口中所谓的奇迹。
而地下都市里那只使徒的个人意志，将决定着未来计划的成功与否。